Bienvenidos alumnos
Este va ser la herramienta para escribir todos ensayos, tienen que enviarme un mail para incluirlos

BIOLOGÍA DE PROCARIONTES

grupo 5286

 martes 11.00-2 PM Salón B002 y viernes laboratorio 11-2

Semestre 2016-1

Profesora Teoría               Valeria Souza, souza.valeria2@gmail.com

Profesor Laboratorio     Manuel García Ulloa Gaméz, manuel.gug@hotmail.com

            vsouzaprocariontes2016.blogspot.mx para postear sus ensayos de lecturas, que están en el dropbox: https://www.dropbox.com/sh/2o4rty6gc2wo46o/AACP-0jKWLGjoSrChNovvRDGa?dl=0

Clave: 1100                                        Modalidad: Asignatura fundamental.

Créditos: 10                                     

Horas por clase de teoría: 3               Horas Teórico-prácticas: 3

Horas por semestre teóricas: 48        Horas teórico-prácticas por semestres: 48

EVALUACIÓN

Calificación final:

50% Teoría

50% Laboratorio

Calificación de Teoría:

40% Exámenes a casa (2)

50% Tareas en equipo, Ensayos 2 cada 15 días obligatorios a partir de una colección de ártículos sugeridos recientes. Los ensayos se subirán a un blog común del grupo y estarán abiertos para todo el grupo. La mayoría es material que viene en la revista Science y microbe de la ASM (American Association of Microbiology), las lecturas son en ingles, ni modo.

10% Exposiciones las bacterias y el hombre

TEMARIO

I. INTRODUCCIÓN 

11 agosto

Microbiología moderna, que estudia y como lo estudia.

Cuatro Cienegas Coahuila, la paradoja del agua en el desierto.

18 de agosto

II. ORÍGEN DE LA VIDA Y EL ORIGEN DE LA DIVERSIDAD

II.1 La escala de tiempo: origen del universo, origen de la vida

II.2. Condiciones de la Tierra primitiva.

II.3. Archeano y los tapetes microbianos

II.4 La primera bola de hielo, el P y el hierro bandeado

II.5 Proteozoico un mundo de estromatolitos

II.6 Origen de los Eucariontes

II.7 Segunda bola de nieve y como cambio el mar

II.8 La explosión del Cámbrico le abre camino a los organismos grandes….y a sus parasitos y comensales…

25 de agosto entrega de lecturas.

1. Sid Perkins (2014) From hell on Earth, life’s building blocks. SCIENCE VOL 346

2. Mitch Leslie (2015) Deep-ocean microbe is closest living relative of complex cells. SCIENCE VOL 348

3. Robert F. Service (2015) Origin-of-life puzzle cracked Science VOL 347

4. Eric Hand (2015) Moon-forming impact left scars in distant asteroids SCIENCE VOL 348.

III. METABOLISMO: Comida

25 agosto y 1 septiembre 

III.1 ATP

III.2 Membranas, reacciones redox  

III.3 Diversidad metabólica y la historia del erase una vez

Fermentación

Respiración anaerobia

Metanogénesis

Quimiolitotrofía

Fotosíntesis anoxigénica

III.4 El mundo ya tiene oxígeno.

Respiración aerobia y Fotosíntesis oxigénica.

Entrega de lecturas 8 septiembre

5. Yuichiro Ueno (2014) Coping with low ocean sulfate. SCIENCE VOL 346.

6. Jeffrey J. Marlow (2015) Methane Fuels Deep-Sea,Rock-Hosted Ecosystem. Microbe. Volume 10, Number 1.

7. Milton Saier (2014) Membrane-Bound Compartments in Bacteria. Microbe. Volume 9, Number 9.

8. E. Anne Edwards (2014) Breathing the unbreathable SCIENCE VOL 346

9. Eric S. Boyd, et. al., (2014) Hydrogen Metabolism and the

Evolution of Biological Respiration. Microbe, Volume 9, Number 9.

10. Licheng Sun (2015) A closer mimic of the oxygen evolution complex of photosystem II SCIENCE VOL 348.

IV. SISTEMÁTICA Y BIODIVERSIDAD

Septiembre 8

IV.1. Sistemática y Clasificaciones

IV.2. Biodiversidad de procariontes

IV.2.1 Dominio Eubacteria

IV.2.2 Dominio Archaea

Entrega de lectura 14 de septiembre

11. Anja Woyke and Edward M. Rubin (2014) Searching for new branches on the tree of life 7 SCIENCE VOL 346.

V. ECOLOGIA ¿quien se como que y cuando?

Septiembre 22 y 29

V 1. Papel de bacterias en el reciclaje de nutrientes

V 2. Biología Molecular y Metagenomica como herramienta de la ecología microbiana

V.3.Estilos de vida e interacciones con otros organismos

VI.3.1. Bacterias de vida libre.

VI.3.1 Parasitismo y Virus

VI.3.2 Mutualismo

VI.3.3 Otras interacciones

                        VI.3.4 Comunidades bacterianas

VI.3.5 Las bacterias como hospederos: bacteriófagos

VI.3.6 Depredadores de bacterias

Lecturas

Entrega de resumenes 29 de septiembre

12. Claudia Benitez-Nelson (2015) The missing link in oceanic

phosphorus cycling? SCIENCE VOL 348

13. Stephen Giovannoni and Diana Nemergut (2014) Microbes ride the current SCIENCE VOL 345

14. Elizabeth Pennisi (2015) Leaf bacteria fertilize trees, researchers claim. SCIENCE VOL 348.

15. Eric J. G. et al., (2015) Quorum Sensing and Social Interactions during Infection. Microbe Volume 10, Number 1

16. Toby Kiers and Stuart A. West (2015) Evolving new organisms via symbiosis SCIENCE VOL 348

29 septiembre Primer examen a casa entregar 6 de octubre.

GENÉTICA y Sexualidad bacteriana

6 y 13 de octubre

            III.1. Genética bacteriana

                        III.1.1. Replicación

                        III.1.2. Transcripción

                        III.1.3. Traducción

                        III.1.4. Elementos genéticos móviles

                        III.1.5. Intercambio genético. Conjugación, transducción y
                        transformación

                        III.1.6. Consecuencias de la transferencia horizontal bacteriana

Entrega de lecturas 20 de octubre junto con modelo de ADN

17 Jiandong Chen and Susan Gottesman (2014) Riboswitch regulates RNA SCIENCE VOL 345

18. Blokesch, (2014) The Lifestyle of Vibrio cholerae Fosters Gene Transfers. ASM microbe.

VI. MIGRACIÓN, ESPECIACIÓN Y EVOLUCIÓN

20 de octubre

            VI 1. Migración: todo esta en todos lados????

VI. 2. Aislamiento receta esencia de la divesificación

VI. 3. Microevolución y el origen de las especies.

VI. 4. Radiaciones adaptativas en el Archaeano, que nos dice la genómica comparada.

entrega de Lectura  27 de octubre

19. B. Jesse Shapiro (2015) What Is Speciation? Microbe. Volume 10, Number 4,

VII. LAS BACTERIAS Y EL HOMBRE

3 al 17 de noviembre.

Clase supervisada por Manuel Ulloa, 2 presentaciones por equipo por clase de los siguientes artículos (1 por equipo, presentación escrita y oral, cada uno con investigación que complemente la información del artículo)

1. Ronald Amundson, et al., (2015) Soil and human security in the 21st century. SCIENCE VOL 348 buscar mas artículos al respecto

2. a. Scott A. Beatson  and Mark J. Walker (2015) Tracking antibiotic resistance. SCIENCE VOL 345

2.b. Manos Perros (2015) A sustainable model for antibiotics Science• VOL 347

3. Shannon Weiman (2014). Bugs as Drugs: Bacteria as Therapeutics against Diseases Microbe. Buscar mas referencias al respecto.

4. Katy Califf et al., (2014)The Human Microbiome: Getting Personal. Microbe—Volume 9, Number 10, 2014. aquí buscar mas referencias del microbioma.

5. Elizabeth Pennisi (2014) Genetics may foster bugs that keep you thin. SCIENCE sciencemag.org 7 NOVEMBER 2014 • VOL 346 ISSUE 6210 aquí buscar mas referencias y estudios en ratones

6a. Bork,et al.,,(2015) Tara Oceans studies plankton at a PLANETARY SCALE SCIENCE VOL 348

6b Shinichi Sunagawa, et al., (2015) Structure and function of the global

ocean microbiome SCIENCE VOL 348 ISSUE 6237.

Examen a casa II, 17 octubre, 24 noviembre entrega de examen a casa y presentación de trabajo en semana de procariontes

Bibliografía:

Libros básicos:

Madigan, Martinko y Parker, 2000. Brock Biology of microorganisms. 9th edition. Prentice Hall, Inc. NJ. USA. (otras ediciones también sirven).

Staley, J.T., R.P. Gunsalus, S. Lory y J. Perry. (2007) Microbial Life. Sinauer Associates, Publishers.

Otros:

Lewin, 1998, Genes VIII.

B. Dixon, 1994, Power unseen, how microbes rules the world. W. H. Freeman, NY.

Nester, E., Anderson, D., Roberts, E., Nester, M. 2006. Microbiology a human perspective. McGraw-Hill Science. 811p

Pommerville, Jeffrey C. 2010. Alcamo's fundamentals of microbiology Sudbury, Massachusetts : Jones and Bartlett.

Wiley, J., Sherwood, L., Woolverton, C. (2009) Prescott/Harley/Klein´s Microbiology seven edition. McGraw-Hill Science. 1088p

Black, Jacquelyn G.(2008) Microbiology : Principles and explorations seven edition. Hoboken, New Jersey : J. Wiley, 422p.